Organizátoři testovali vodu v 26 dnech od července do září. Kvalita vody odpovídala požadavkům mezinárodních federací jen v deseti dnech pro plavání a v šesti dnech pro triatlon.
Určitý podíl viny měly tři týdny, kdy v japonské metropoli v srpnu bez ustání pršelo. Déšť totiž splachuje nečistoty z pobřeží do vody.
Pořadatelé ujišťovali, že při olympiádě budou mít situaci pod kontrolou. Uvažují o instalaci podvodních clon, které by zabránily průniku znečištění z pobřeží při dešti. V případě potřeby mohou pozměnit dny a časy závodů s ohledem na aktuální kvalitu vody.
"Přijmeme nejlepší možná opatření, abychom zajistili, že sportoviště splňuje všechny standardy mezinárodních federací a že sportovci budou moci závodit velmi bezpečně," řekl sportovní ředitel organizačního výboru Kodži Murofuši, olympijský vítěz v hodu kladivem z roku 2004.
